No início do século XX, envolvidas pela atmosfera missionária irradiada pela Santa Sé e também pela leitura de revistas e boletins sobre missões, as irmãs Aloísia Casemira Cach e Rosa Antonina Hutnik, hoje fundadoras da Congregação das Irmãs Franciscanas da Santíssima Trindade, sentiram um forte apelo missionário. Impulsionadas pela inspiração do Divino Espírito Santo, deixaram a vida contemplativa do mosteiro na Polônia e partiram para um trabalho missionário no Brasil.

No ano de 1928 as irmãs Aloísia Casemira Cach e Rosa Antonina Hutnik enviaram do Convento do Lowicz na Polônia à Sagrada Congregação dos Religiosos de Roma o pedido para uma nova fundação das Irmãs da Terceira Ordem Regular de São Francisco de Assis no Brasil, o qual foi deferido.

As fundadoras com mais três irmãs de outro Mosteiro, chegaram a Dom Feliciano, RS no dia 28 de agosto de 1929.

Nesta localidade exerceram várias atividades na educação, saúde, assistência aos desamparados, trabalhos paroquiais, catequese, artesanato e outros. Após três anos de trabalho, luta e sofrimento, Madre Aloísia e Madre Rosa deixaram aquela localidade e estabeleceram-se em Guarani-Mirim, município de Massaranduba, SC Diocese de Joinville.

A Congregação começou a expandir-se na Diocese de Joinville e em outras Dioceses.

Inicialmente as Irmãs moravam em casas simples junto às paróquias das pequenas cidades e vilas do interior. Mais tarde, para atender a formação profissional das Irmãs, a Congregação estendeu suas atividades para as capitais do Paraná e Santa Catarina.

A nova fundação brasileira, de Direito Diocesano, conservou o nome de origem até 1962. A partir desta data, passou a denominar-se "Congregação das Irmãs Franciscanas da Santíssima Trindade". Com a nova denominação, começou o aprofundamento do Carisma, Missão e Espiritualidade Franciscana Trinitária.